La gestion du projet est assurée par le chef de file par le recours à des consultants externes ayant une expérience dans le domaine de la gestion des programmes de coopération. La structure de gestion prévoit deux rôles de gouvernance :

1. a) un chef de projet recruté en externe par le chef de file ;
2. b) une direction scientifique en charge du sujet délégataire du GIP Université de Nice.

La structure de gestion comprend également les organes de gouvernance suivants :

• Le comité de pilotage institutionnel qui joue le rôle d’accompagnement transversal en exerçant des fonctions d’orientation, de suivi et d’évaluation en cours de route par rapport aux activités prévues. Il assure le bon déroulement des travaux et la communication entre les partenaires, entretient les relations avec l’Autorité de Gestion, contrôle l’avancement des dépenses et le respect des contraintes et des échéances du Programme. Le comité est composé des représentants de chaque partenaire, des agents d’exécution et des membres de gouvernance recrutés en externe.
• Une équipe technique pour la conception et la coordination des actions d’identification et d’accompagnement. L’organisme conçoit et coordonne les activités prévues par le WP3, gère les échanges transfrontaliers, réalise les outils, définit et planifie la formation des formateurs, supervise la réalisation des expérimentations sur le terrain.
• Deux équipes techniques pour la conception et la coordination des alliances éducatives et des parcours de persévérance et de réussite scolaire. Les organes coordonnent les activités prévues par le WP4, gèrent les échanges transfrontaliers, mettent en œuvre les outils, définissent et planifient la formation des formateurs, supervisent la réalisation des expérimentations sur le terrain.
• Des équipes d’enseignants des écoles pour expérimenter les parcours de persévérance et de réussite scolaire.
  L’évaluation et le suivi du projet relèvent de la responsabilité du Comité de Pilotage qui fait appel à des consultants externes, sélectionnés par le délégataire, l’Université de la Vallée d’Aoste, pour garantir le principe d’impartialité.